Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN11AQ9UI33 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms