Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPS7AQ9UBW8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPS7AQ9UBW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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