Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC6Q9UBN7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC6Q9UBN7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms