Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CC2D2AQ9P2K1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CC2D2AQ9P2K1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms