Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HCN3Q9P1Z3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms