Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMG20BQ9P0W2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms