Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLRF1Q9NZS2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLRF1Q9NZS2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms