Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTEL1Q9NZ71 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTEL1Q9NZ71 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms