Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf78Q9NZ63 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf78Q9NZ63 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms