Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTMR4Q9NYA4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTMR4Q9NYA4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms