Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLE1Q9NVX2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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