Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR3EQ9NVU0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLR3EQ9NVU0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms