Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106BQ9NUM4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms