Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHDC1Q9NTX5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms