Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms