Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG3Q9NT62 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG3Q9NT62 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms