Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX1Q9NSU2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX1Q9NSU2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms