Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRP7BPQ9NSQ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2436 ms