Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNNM1Q9NRU3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms