Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PLXNA4Q9HCM2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLXNA4Q9HCM2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms