Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms