Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LNPKQ9C0E8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LNPKQ9C0E8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms