Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms