Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN1Q9BY11 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms