Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms