Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTKNQ9BST9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms