Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms