Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUSP9Q99956 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms