Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2BQ99453 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2BQ99453 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms