Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRBNQ96SW2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms