Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAM1Q96QH2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAM1Q96QH2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms