Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALS2Q96Q42 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms