Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCLT1Q96NL6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms