Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35E1Q96K37 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms