Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCMH1Q96GD3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCMH1Q96GD3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms