Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms