Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EDC3Q96F86 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms