Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C18orf8Q96DM3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms