Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms