Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC102AQ96A19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms