Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRG4Q92954 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms