Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHDC4Q8TBB5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms