Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD1Q8NHV4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD1Q8NHV4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms