Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ5

GPRC5A, Retinoic acid-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5AQ8NFJ5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPRC5AQ8NFJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPRC5AQ8NFJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPRC5AQ8NFJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms