Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC191Q8NCU4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC191Q8NCU4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms