Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPC24Q8NBT2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms