Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT2Q8N9I0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT2Q8N9I0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms