Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP4Q86YS3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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