Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms