Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CATSPER4Q7RTX7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CATSPER4Q7RTX7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms